محاولة إظهار الموقع أو المتجر الإلكتروني في أعلى مرتبة ممكنة في صفحة نتائج محركات البحث SERP بشكل مجاني أو طبيعي أو كما يسمى عضوي (Organic) هو ما يطلق عليه تحسين أو تهيئة محركات البحث (Search Engine Optimization)، أما التسويق عبر محركات البحث (Search Engine Marketing) هو محاولة ظهورها في صفحة نتائج محركات البحث ولكن بشكل مدفوع ضمن النتائج الإعلانية والذي يكون إما في أعلى صفحة نتائج البحث أو أسفلها، فأهم نقاط الاختلاف بينهم أن تحسين محركات البحث SEO مجانية والتسويق عبر محركات البحث SEM مدفوعة أيضا يحتاج تحسين محركات البحث إلى جهد كبير إضافة الى أن ظهور نتائجه تحتاج إلى أسابيع ووقت طويل، على العكس في التسويق عبر محركات البحث التي تظهر نتائجها مباشرة خلال ساعات على محركات البحث من خلال الإعلان المدفوع، كما أنه يمكن بسهولة قياس العائد منها على الاستثمار، وإذا تعمقنا النظر فيهما بشكل أكبر نجد أن كلاهما بالتأكيد يحتاجان إلى جهد وموارد فمع أنه في تحسين محركات البحث لا نقوم بدفع أي تكاليف إعلانية للتواجد في محركات البحث إلا أنها تحتاج إلى مطورين مختصين في برمجة المواقع الإلكتروني بغرض تلبية المتطلبات التقنية لمحركات البحث أيضا مختصين في كتابة المحتوى لتوفير محتوى حصري وفريد ومميز مكتوب بلغة حية يكون له إقبال لدى شريحة واسعة من الجمهور المستهدف، أيضا كلاهما يحتاج إلى مختصين وذات خبرة في اختيار كلمات البحث المفتاحية سواء أكان عند كتابة المحتوى أو كان عند عمل الإعلان.

وبالحديث عن أهم محركات البحث "محرك البحث غوغل" (Google Search Engine) الذي يعتمد الظهور فيه بأعلى مراتب صفحة نتائج البحث (سواء أكان بشكل مجاني طبيعي أو بشكل إعلاني) على "الخوارزم" وهي المعادلات التي تضعها غوغل على كلا الشكلين الطبيعي والاعلاني والتي من الصعب بما كان معرفة تفاصيل هذه الخوارزم (حيث يمكن الجزم بأنه لا أحد يعلم بشكل تام عناصر هذه الخوارزم غير مهندسي غوغل فقط) كما أنها تتغير وتتحدث بشكل طفيف وباستمرار من قبل غوغل، ولكن من خلال النصائح التي تقدمها غوغل بشكل دوري ودائم لمديري المواقع أيضا من خلال الخبرات المتراكمة وأسلوب التجربة والخطأ فبالإمكان استنتاج بعض عناصر هذه الخوارزم، والتي من أهمها مدى سرعة الموقع او المتجر وقابليته للتكيف وتعديل حجمه بحسب نوع ومقاس شاشة جهاز المستخدم أو ما يسمى (Responsive) وبالذات مدى جودة ظهوره على جهاز الجوال (Mobile-Friendly)، كذلك تواجد الكلمات المفتاحية الأكثر أهمية لدى المستخدمين في محتوى وعناوين صفحات الموقع، أيضا سمعة الموقع او المتجر التي تقاس بعدة عناصر منها عدد الزيارات للموقع وطول الفترة التي يقضيها الزائر في الموقع وعدد الصفحات التي يزورها في كل "جلسة زيارة" (Session) كذلك معدل النقر داخل الموقع وأيضا طول الفترة التي يقضيها الزائر في الموقع بداية من النقر على رابط الموقع في محرك البحث والقيام بتصفحه وحتى العودة لمحرك البحث مرة أخرى وهذا ما يسمى (Dwell time) إضافة إلى انخفاض معدل الارتداد (Bounce Rates) للصفحة والذي يقيس معدل الدخول ثم الخروج من صفحة الموقع دون القيام بأي تفاعل أو النقر داخلها، كذلك سهولة الوصول لجميع صفحات الموقع من خلال الروابط الداخلية للموقع بحيث تكون جميع صفحات الموقع متشابكة مع بعض، أيضا مدى انتشار رابط الموقع أو المتجر الإلكتروني في مختلف المنصات والمواقع الأخرى، وبالتالي تشير معظم هذه العناصر إلى مدى جودة الموقع ونتيجة لها يتم رفعه إلى أعلى مرتبة ممكنه في صفحة نتائج محركات البحث.