من الاسباب كذلك التي تؤدي ألم التبول عند المرأة هو التهاب الكلية والحويضة الحاد حيث ان هذا الالتهاب نادراً ما يسبب التبول المؤلم المنفرد عند النساء، وذلك بنسبة لا تزيد على 5٪ من تلك الحالات، رغم أن معظمهن قد يشتكين منه، ولكن مع أعراض سريرية أخرى، مع أو بدونه، تشمل آلام الخاصرة والحمّى والغثيان والتقيؤ والاجهاد والارتعاش والنافض، وأعراضاً سريرية أخرى كالالام في الخاصرة ما بين الضلع والعامود الفقري أو في أعلى البطن جانبياً، علاوة على وجود بيلة قيحية في تحليل البول الجهري وأكثر من 100,000 جرثومة في مزرعته. وتعالج هذه الحالة حسب شدتها وعمر المريضة وحالتها الصحية العامة، اما بالاستشفاء لبضعة ايام أو في بعض الحالات بمعالجة المريضة مبدئياً بالمضادات الوريدية في غرفة الطوارئ ومن ثم بالأقراص إذا ما كانت حالة المريضة غير خطيرة وحادة وإذا ما تمكنت من تناول الأغذية والعقاقير من الفم بدون وجود غثيان أو تقيؤ. ويحبذ معظم الاخصائيين القيام بالأشعة فوق الصوتية أو المقطعية في تلك الحالات لتشخيص أية آفات كلوية أو في الجهاز البولي تكون مسببة لهذا الالتهاب الحاد.